中国自然科学博物馆界的群众性学术团体。会址设在北京自然博物馆内。它的宗旨是:团结全国各种类型的自然科学博物馆及其广大工作者,开展自然科学博物馆、动物园、植物园、自然保护区之间的业务交流活动,提高博物馆工作质量,推动自然科学博物馆事业的发展,为实现社会主义四个现代化服务。
1976年北京自然博物馆受有关博物馆的委托,发起成立中国自然科学博物馆协会,并由北京自然博物馆、中国地质博物馆、北京天文馆等联合提出倡议。1979年10月,由中国科学技术协会主持,在江苏省南通市召开了中国自然科学博物馆协会筹备会议。会议讨论通过了《中国自然科学博物馆协会章程(草案)》,选举产生了中国自然科学博物馆协会筹备委员会,由中国科学院学部委员、著名古人类学和考古学家裴文中教授任筹备委员会主任。
1980年11月27日,中国自然科学博物馆协会成立大会在北京召开。大会收到论文 100多篇,就自然科学博物馆的学术成果和工作经验进行了广泛交流。会议讨论通过了《中国自然科学博物馆协会章程》,选举产生了第一届理事会和常务理事会,由裴文中任理事长;会议还通过了给国务院的《关于加强我国自然科学博物馆事业的建议书》。
中国自然科学博物馆协会从成立到1989年底,已召开了两届会员代表大会、3次学术讨论会,就自然博物馆的性质、作用、如何为建设社会主义物质文明和精神文明服务以及陈列展览的内容与形式设计等问题,进行了深入的探讨和交流,并出版了3本论文集。1987年,在第二届会员代表大会上,决定在协会下设博物馆学理论研究会、教育工作委员会、宣传出版委员会、外事委员会、咨询开发委员会、组织委员会和自然保护区研究会,分别开展工作。此外,协会还组织多次博物馆技术培训班,引进并出国举办自然科学展览等。
中国自然科学博物馆协会到 1989 年共有团体会员121个,个人会员 922名。出版物有 《大自然》(季刊)、《中国自然科学博物馆协会通讯》 (内部发行,每年两期)。